Дворцовое село Павшино на Москве-реке впервые упоминается в 1462 г. в духовной грамоте великого князя Московского Василия Темного. В нем издавна стояла деревянная Никольская церковь, на месте которой в 1817—1821 гг. построили ныне существующую каменную церковь с приделом во имя пророка Илии. Трапезная перестроена в 1881 г.
В середине 19 века началась эпидемия холеры, большая беда пришла и в Павшино. Прихожане взяли Боголюбскую икону Божией Матери и прошли с ней крестным ходом вокруг села. И случилось чудо - болезнь отступила. В честь этого события в 1866—1873 гг. рядом с Никольским храмом построили каменную трехпрестольную церковь в честь Боголюбской иконы Божией Матери (приделы пророка Божия Илии и великомученика Георгия Победоносца). Храм был возведен на пожертвования.
Чудотворная икона находится в
Боголюбском храме по сей день.
В 1895 г. храм освятили после ремонта, произведенного на средства крестьян Е.П.Крюкова и Н.А.Терехова.
B начале XX века после революции в нашей стране закрывались многие храмы. В 1920 году Никольская церковь закрывается и в ней размещается Красногорский металлический завод: внутри устраиваются дополнительные этажи и перегородки, живописные поверхности заштукатуривают и закрашивают. Искажается эстетическая и пространственная составляющая комплекса. Его стали использовать не в религиозных целях. Купол храма превращается в место для парашютного спорта.
За советские годы был уничтожен находившийся в храме иконостас конца XVII века из Зачатьевского монастыря, разрушены верхние ярусы колокольни. Однако Боголюбская церковь ни разу не закрывалась со времени своего возведения.
В 1980 году зданию Никольского храма присваивается статус объекта культурного наследия.
3 ноября 2003 года оно передается в пользование Местной православной организации прихода Никольского храма г. Красногорска Московской области, Русской Православной церкви.
22 мая 2013 в Никольском храме г.Красногорска (микрорайон Павшино) была отслужена первая после закрытия в годы гонений Божественная Литургия.
К 2021 году проделано много работы по реставрации храма: восстановлены фасады, установлен купол с крестом, вставлены окна. На сегодняшний день ведутся работы ,а их тоже немало, по внутреннему убранству храма.
